NVIDIA支援でSandboxAQが革新的AI創薬データ生成技術を発表

2025年06月19日

NVIDIAとSandboxAQが提携し、AI創薬の研究期間を95%短縮する技術を開発
520万件の合成分子構造を含むSAIRデータセットを公開、従来の1000倍高速化を実現
大規模定量モデル（LQM）プラットフォームで物理学と化学を統合したAI創薬を推進

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NVIDIA DGXクラウドが支える次世代AI創薬プラットフォーム

SandboxAQは、NVIDIA DGXクラウドとの戦略的提携により、大規模定量モデル（LQM）プラットフォームを開発しました[1]。このプラットフォームは、従来の「設計・製造・テスト」のワークフローを革新し、バイオ医薬品、化学、医療画像の分野で科学的発見を加速させています。LQMは、AIと物理学、化学、経済学の専門モデルを組み合わせることで、信頼性の高い結果を提供します。

この技術により、創薬の発見タイムラインが従来の数ヶ月から数週間へと4倍高速化されました[1]。方程式ベースのシミュレーションと多パラメータ最適化を活用することで、物理実験に依存せずに高精度な分子相互作用の予測が可能になっています。NVIDIA DGXクラウドとGoogle Cloudの統合により、スケーラブルな計算環境が実現されています。

この提携は、AI創薬における計算能力の限界を突破する画期的な取り組みです。従来の創薬プロセスは、まるで暗闇で針を探すような作業でした。数千、数万の化合物を実際に合成し、一つずつテストする必要があったのです。しかし、LQMプラットフォームは、この暗闇に強力なサーチライトを当てるようなものです。物理法則と化学原理をAIに組み込むことで、実験前に結果を高精度で予測できるようになりました。これは単なる効率化ではなく、創薬研究のパラダイムシフトを意味します。

520万件の合成分子構造を含むSAIRデータセット公開

SandboxAQは、NVIDIA DGXクラウドとLQMを活用して開発したSAIR（Structurally Augmented IC50 Repository）データセットを公開しました[3]。このデータセットには520万件の合成3D分子構造と結合親和性ラベルが含まれており、AIモデルがタンパク質-リガンド相互作用を従来の1000倍高速で予測することを可能にします。物理ベースのモデリングと生成AI技術を組み合わせた革新的なアプローチです。

SAIRデータセットの特徴は、物理的に合成されていない現実的な3D分子構造を含んでいることです[4]。これにより、数十億の化合物相互作用を仮想スクリーニングで評価できるようになり、創薬のスクリーニング時間を数年から数週間に短縮することが可能になりました。NVIDIAとの協力により、GPU利用率も2倍向上しています。

SAIRデータセットの公開は、創薬業界における「データ不足」という根本的な課題を解決する革命的な取り組みです。これまでの創薬研究は、限られた実験データに依存していました。まるで、わずかな地図の断片だけで未知の大陸を探検するようなものでした。SAIRは、この状況を一変させます。520万件の合成分子構造は、創薬研究者にとって詳細な地図帳のようなものです。しかも、これらの分子は実際に合成する必要がないため、コストと時間を大幅に削減できます。オープンデータセットとして公開することで、世界中の研究者が利用でき、創薬研究の民主化も促進されるでしょう。

自律型AIケミストによる化学経路の自動探索

SandboxAQが開発したAgentic AIケミストは、LQMを活用して化学経路を自律的に探索し、臨床応用向けの化合物を最適化します[6]。この技術により、分子相互作用と生物学的システムの高精度シミュレーションが可能になり、製薬パイプラインにおけるヒット・トゥ・リード変換率と標的検証精度が向上しています。82個の電子を持つシステムの軌道最適化という技術的ブレークスルーも達成されました。

この自律型システムは、触媒や材料科学の分野でも分子シミュレーションを改善しており、GPU加速量子化学により従来比80倍の高速化を実現しています[7]。SandboxAQは4億5000万ドルのシリーズE資金調達を完了し、プラットフォームの拡張を支援しています。高精度シミュレーションにより物理実験を代替し、R&Dコストと失敗リスクを削減しています。

Agentic AIケミストの登場は、創薬研究における人工知能の役割を根本的に変えるものです。従来のAIは、人間が与えたデータを分析する「受動的な助手」のような存在でした。しかし、Agentic AIケミストは「能動的な研究パートナー」として機能します。まるで、24時間休むことなく、数千の化学反応を同時に検討できる超人的な化学者のようなものです。82個の電子システムの軌道最適化という技術的成果は、量子化学計算の新たな地平を開いています。これは、より複雑で現実的な分子システムをシミュレーションできることを意味し、創薬の精度向上に直結します。

まとめ

NVIDIAとSandboxAQの提携は、AI創薬分野における技術革新の新たな章を開きました。LQMプラットフォーム、SAIRデータセット、Agentic AIケミストという三つの柱により、創薬研究の効率性と精度が飛躍的に向上しています。この技術は創薬だけでなく、材料科学やサイバーセキュリティなど幅広い分野への応用も期待されており、科学的発見の加速化に大きく貢献することが予想されます。